Desde la versión 11.10 de Ubuntu 11.10 (gcc 4.6.1) el orden de enlazado de las librerias importa, por lo que ahora tenemos que enlazar gtk y glade al final de la llamada a gcc:
echo linking...
gcc $1.o -o$1 -L./../lib -L./../../harbour/lib pkg-config --libs libgnomeprintui-2.2 -Wl,--start-group -lfive -lfivec -lhbcommon -lhbvm -lhbrtl -lhbrdd -lhbmacro -lhblang -lhbcpage -lhbpp -lhbcplr -lrddntx -lrddcdx -lrddfpt -lhbsix -lhbusrrdd -lhbct -lgttrm -lhbdebug -lm -lgpm -lncurses pkg-config --libs gtk+-2.0 pkg-config --libs libglade-2.0 -Wl,--end-group
Con esos cambios, vuelve a funcionar bien! 